La vocation de Sidaction est de lutter contre l'épidémie et d'améliorer la qualité de vie des personnes touchées par le sida. Cette complémentarité voulue par Sidaction est, depuis l'origine, affirmée dans ses statuts : tous les fonds recueillis doivent être répartis à égalité, soit 50 % pour les programmes de recherche et 50 % pour les programmes de prévention et d'aide aux malades. Ce principe fondamental guide toutes les actions de Sidaction qui décide librement de l'orientation des fonds recueillis. Anticiper, analyser et définir les nouveaux besoins, trouver les réponses adaptées, initier de nouvelles voies de recherche, préparer la recherche de demain en aidant les jeunes chercheurs, imaginer de nouvelles méthodes de prévention, développer l'accès aux soins dans les pays en développement, mettre en œuvre de nouvelles formes de lobbying, Sidaction intervient dans tous les domaines pour faire face à l'évolution de l'épidémie et répondre le plus efficacement possible aux nouvelles urgences de l'accompagnement des malades. En finançant des programmes innovants, en soutenant et en renforçant des programmes existants, enfin en développant ses propres programmes et en favorisant l'émergence de nouvelles initiatives.